Возможно ли после оплаты взыскать с заказчика неустойку и в каком порядке это сделать?

Ответ: Конечно можно. И не обязательно для этого ждать оплаты заказчика. Считаю, что вам уже сейчас необходимо направить заказчику требование оплаты выполненных работ с указанием необходимости оплаты неустойки за каждый день просрочки исполнения обязательства по оплате.

Кроме того, включите в письмо информацию об административной ответственности заказчика за нарушение сроков оплаты.