Заказчик отказывается принимать протокол разногласий и убирать формулировку об НДС из контракта. Мы на УСН, что делать?

Ответ: Считаю лучшим решением будет обратиться с жалобой в УФАС по месту регистрации Заказчика.

В жалобе нужно указать на неправомерный отказ Заказчика от внесения соответствующих изменений в проект контракта и предоставить все документы касающиеся процесса заключения контракта.

В жалобе необходимо ссылаться на:
Определение Верховного Суда Российской Федерации от 19.03.2019 № 302-КГ18-24863 «О неправомерности отказ заказчика учитывать режим налогообложения победителя при изложении условий контракта о цене»
Письмо ФАС России от 18.06.2019 № ИА/50880/19 «О разъяснении положений Федерального закона от 05.04.2013 N 44-ФЗ в части заключения государственного контракта с победителем закупки, применяющим упрощенную систему налогообложения»

В резолютивной части просите УФАС приостановить заключение контракта до рассмотрения жалобы по существу и обязать заказчика внести изменения в проект контракта с учетом вашего режима налогообложения.