Имеет ли право заказчик отклонить заявку, если решение о крупной сделке подписано директором?

Ответ: Если участник общество с ограниченной ответственностью, то в соответствии с требованиями ст. 46 Федерального закона от 08.02.1998 № 14-ФЗ решение о крупной сделке должно приниматься на общем собрании участников общества.

Кроме общего собрания участников общество решение может быть принято советом директоров, если такое положение имеется в уставе общества.

Еще один случай, когда директор ООО может принять решение о крупной сделке - когда он является одновременно единственным участником и единоличным исполнительным органом.

Таким образом в указанных случаях​ ваша заявка не может быть отклонена.