Можно ли государственным и муниципальным заказчикам закупать Microsoft Windows и MS Office?

Ответ: Конечно, можно.

Во-первых, Вы можете купить не напрямую у Microsoft, то есть программное обеспечение не будет передаваться по каналам связи, происходящим из иностранных государств.

Во-вторых, решение Microsoft может быть приобретено как составная части российского программного продукта (например, Turbo Planner).

В-третьих, Вы можете продлевать лицензию, а не покупать новый продукт (см. решение Вологодского УФАС России от 03.03.2016 г. по делу № 5-2/25-16).

В-четвертых, Вы можете купить компьютер с установленным на ним программным обеспечением. Плюс к этому читайте внимательно пункт 2 указанного в Вашем вопросе постановления, там еще пара исключений.